為了解決養豬最難處理也最不容易見到效果的環保問題，從2005年開始，在山東、福建等省興起了發酵高床養豬（有的叫自然養豬法）的新技術，現在，很多省份特別是養豬業發達的地區，也都采用該方法養豬，不過大部分在試驗、觀察效果。很多從事研究的專家和菌種生產廠家認為墊料可以使用3年，也吸引了一部分規模化大型豬場進行試驗研究。
發酵高床養豬在管理到位的情況下確實能解決環保問題，沒有污水排出來，也減少了沖豬舍的水量，另外，豬舍的氨味及其他異味大幅度減少，豬只的健康水平有所提高，豬只發病數量明顯減少本場做了4個豬欄，墊料厚80cm，谷殼和鋸末各半，從2008年9月份開始試驗，每個欄36 m2（包括6X1m2的喂料平臺），放25～30頭豬/欄，現在第2批試驗豬已準備出欄。在試驗的過程中，遇到一些問題，提出來與同行探討一下。
1 、原料問題
從環保的角度出發，墊料只要能用1年時間，不要說3年，只要成本適當，很多豬場都會使用。但是，墊料的量是一個問題。每平方米的墊料（80cm厚），需要谷殼和鋸末各4包（30～35kg重）左右，因此，原料的需求量非常大。鋸末中，根據專家介紹，桉樹的鋸末由于不利于菌種的生存而不能使用，只能用其他樹木的。如果大范圍推廣該技術，原料（除了谷殼和鋸末）的篩選工作比較重要，因為要有足夠的量，而谷殼和鋸末的量畢竟有限。
我國很多地區要么小麥產量大，要么大米產量大，或者玉米生產量大，而這些作物的秸稈作為農副產品多作為肥料或家畜的飼料使用，價值發揮不充分。如果能粉碎后作為重要的一種墊料成分，應該能解決這一問題。即使這些原料降解的速度與鋸末比比較快，但如果能用一年時間，不斷進行補充，也會節約相當可觀的成本。
2 、墊料位置問題
做發酵高床的豬欄，一般墊料層深60～80cm，而地面多數是不鋪水泥的（要求是一定不鋪），在山東等地，料床是挖到地下的，床面和地面平，這種做法一方面節約做磚墻的成本，另一方面，添加飼料、驅趕豬只十分方便。這種地下欄在北方比較適合，因為氣候比較干燥，地下水位底，不容易滲水在南方，大部分豬場建在山區，并且很多豬舍是圍著山腳而建，如果采用這種方法，由于南方氣候潮濕，山區的地下水位一般比較高，如果下面又沒有鋪設水泥地面，當地下水滲透到一定程度時，墊料下層濕度過大，容易變質。
區別不同地區的情況，墊料的位置是在地上還是地下不要一個模式。南方最好在地面上建發酵高床，但可以在下面鋪一層稻草，以減少地下水份的影響。
3 、建筑面積問題
根據很多資料和專家的介紹，發酵高床養豬密度為1.2～1.5 m2/頭，但沒有說明是根據整個欄的面積還是墊料床的面積算出來的。如果是整個欄的面積，那么要把水泥地面的部分（吃料臺和飲水臺，有的還有涼臺。大的占總面積的四分之一，小的也有十分之一以上）減去，按墊料面積來分，可能一頭豬也就占1 m2左右， 作為大豬來說，1 m2的墊料每天要分解1.5 kg左右的糞便，還有尿液，應該承受能力達不到，效果也不理想。如果單單是根據墊料面積來算，到大豬的時候，加上飼料臺、飲水臺，平均每豬占據面積要1.8～2.0 m2，可能在建筑面積方面要增加相當成本，那就不是每個豬場都能承受得了的。
